Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopeO89079 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopeO89079 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopeO89079 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms