Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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