Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms