Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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