Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms