Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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