Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Efna3O08545 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms