Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms