Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28051J3QMA2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms