Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610008E11RikG3X964 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610008E11RikG3X964 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms