Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip11E9Q512 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms