Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms