Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms