Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms