Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms