Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms