Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Gm6880A3KG45 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm6880A3KG45 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm6880A3KG45 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm6880A3KG45 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm6880A3KG45 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm6880A3KG45 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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