Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc4dA1L0T3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssc4dA1L0T3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssc4dA1L0T3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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