Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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