Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms