Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn7Q9Z261 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn7Q9Z261 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn7Q9Z261 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn7Q9Z261 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn7Q9Z261 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn7Q9Z261 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn7Q9Z261 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms