Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181 ms