Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk2Q9R088 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms