Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc1Q9QZF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gpc1Q9QZF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms