Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ercc4Q9QZD4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms