Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms