Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms