Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlr5Q9JLF7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms