Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms