Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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