Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc28a3Q9ERH8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc28a3Q9ERH8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms