Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr61Q9ERF3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms