Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms