Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clca3a2Q9EQR4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clca3a2Q9EQR4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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