Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SyncQ9EPM5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms