Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr88Q9EPB7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr88Q9EPB7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms