Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms