Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms