Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc103Q9D9P2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms