Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmco5aQ9D9D5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmco5aQ9D9D5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmco5aQ9D9D5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmco5aQ9D9D5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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