Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Q9D8Q6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Q9D8Q6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Q9D8Q6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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