Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl17Q9D8P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl17Q9D8P4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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