Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8N1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms