Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Q9D7E4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Q9D7E4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms