Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms