Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms