Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms