Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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