Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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