Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms